A kutatások szerint a napi 3–4 csésze kávé fogyasztása csökkentheti a cukorbetegség, a szív- és érrendszeri betegségek, egyes daganatok, valamint a Parkinson-kór kockázatát. Ezek az előnyök elsősorban a kávé antioxidáns vegyületeinek, például a klorogénsavnak és ferulsavnak köszönhetők. A koffeinmentes kávé is tartalmazza ezeket a hasznos összetevőket, így a pozitív hatások érvényesülnek koffein nélkül is.
Sokan tartanak attól, hogy éhgyomorra fogyasztva a kávé refluxot vagy gyomorpanaszokat okoz. A szakember szerint egészséges embereknél ez ritkán fordul elő, a kockázatot inkább az elhízás, dohányzás, alkoholfogyasztás és stressz növeli. Hasonlóképpen, a mérsékelt kávéfogyasztás nem okoz jelentős vérnyomás-emelkedést, a hipertóniásoknak elsősorban az életmódbeli tényezőkre érdemes koncentrálniuk.
Fontos szempont a kávé elkészítési módja is. A feketében, szűretlenül fogyasztott kávé (pl. french press, török kávé) tartalmazhat olyan vegyületeket, amelyek hosszabb távon emelhetik az LDL-koleszterinszintet, ezért a rendszeresen nagyobb mennyiséget fogyasztók számára a filteres verziók előnyösebbek. A pörkölés mértéke szintén befolyásolja az egészségvédő hatást: a világosabb pörkölésű kávéban több hasznos antioxidáns marad meg, míg a sötétebb pörkölés során káros vegyületek keletkezhetnek.
Az instant kávé, bár kevésbé aromás, szintén tartalmaz koffeint és antioxidánsokat, így a fogyasztása egészséges alternatíva lehet. A koffein vízhajtó hatása elsősorban nagy mennyiségű kávé esetén érvényesül, ezért érdemes mellé vizet fogyasztani.
A kávé egészségvédő hatása a legegyértelműbben tisztán, cukor és tej nélkül érvényesül. Ilyenkor nemcsak az antioxidánsok hatnak, de fogszuvasodást gátló hatása is van, és kalóriabevitel szempontjából is előnyösebb. Szabó Adrienn szerint a világos pörkölésű, mérsékelt fogyasztás a legjobb módja, hogy a kávé élvezeti és egészségvédő előnyeit egyaránt kihasználjuk.


