Klein a közép-amerikai országban lévő ökotanyáján vakációzott, amikor a szerencsétlenség történt. Szemtanúk szerint a Cessna 172-es típusú kisrepülőgép feltűnően alacsonyan haladt erős széllökések közepette az őserdő borította Baru vulkán oldalában, amikor lezuhant.
A mentőalakulatok csak szerdán tudták lehozni ötórás "gyalogtúrával" a nehezen megközelíthető hegyoldalból a zuhanást kisebb sérülésekkel túlélő 12 éves Francesca Lewist, aki az üzletember lányának barátnőjeként üdült az ökofarmon. A lány egy törött karral és kihűléssel megúszta a szerencsétlenséget.
A briliáns üzletemberként ismert Michael Klein volt a vezérigazgatója a világ legnagyobb e-mail kommunikációs szolgáltatójának, az eGroups Inc.-nek, mielőtt azt a Yahoo Inc. 2000-ben 450 millió dollárért bekebelezte, s a két cég egyesüléséből létrejött a Yahoo Groups.